蔡元培故居的地址位于紹興城區(qū)筆飛弄13號(hào)。在1989年12月被浙江省人民政府公布為浙江省文物保護(hù)單位,2001年6月被國(guó)務(wù)院列入第五批全國(guó)重點(diǎn)文物保護(hù)單位。
蔡元培祖籍諸暨,明隆慶、萬(wàn)歷年間遷居山陰(今紹興),蔡元培的嘉謨公于清道光年間在筆飛弄購(gòu)置房屋。1868年1月11日,蔡元培誕生于此,座樓東次間是他的書房兼臥室。在他28歲進(jìn)京任翰林院編修前及在紹郡中西學(xué)堂任職和歷次返鄉(xiāng)時(shí)都居住在此處。在中華人民共和國(guó)成立前,蔡元培故居由蔡氏后裔及外姓居民居住。
1987年,為紀(jì)念蔡元培誕辰100周年,紹興市人民政府對(duì)第一、二進(jìn)住戶進(jìn)行勸遷,由文管處實(shí)施,按原樣修復(fù),建成蔡元培紀(jì)念館。
蔡元培故居的主體建筑是坐北朝南,為磚木結(jié)構(gòu),共三進(jìn)。第一進(jìn)門廳坐西朝東,上懸劉海粟手書“蔡元培故居”匾額;第二進(jìn)廳堂和第三進(jìn)樓房均坐北朝南,三進(jìn)分布不在同一軸線上。第二進(jìn)一堂兩廳,已辟為陳列室,堂廳正中放著蔡元培半身塑像,頗有學(xué)者風(fēng)度。左壁懸有毛澤東撰、沙孟海書的“學(xué)界泰斗,人世楷?!本薹?lián)語(yǔ);右壁有周恩來(lái)撰、沈定庵書的“從排滿到抗日戰(zhàn)爭(zhēng),先生之志在民族革命;從五四到人權(quán)同盟,先生之行在民主自由”的對(duì)聯(lián)。后進(jìn)為坐樓,五樓五底,蔡元培就出生在此處,并度過(guò)了童年和青少年時(shí)代。蔡元培故居大廳前廂房、大廳及兩邊間、座樓前西廂房及座樓西邊間均辟為“蔡元培生平史跡陳列室”,介紹蔡元培先生一生業(yè)績(jī)。